Die jong skilpad het pas opleiding in ninja-gevegsvaardighede met Tibetaanse monnike voltooi. Die skilpad het 'n swart gordel gekry en nou kan hy sy droom verwesenlik. Sy het lank gedroom om in die span van die legendariese Teenage Mutant Ninja Turtles aanvaar te word. Maar net so sal die held nie aanvaar word nie, hy moet spesiale verdienste hê, en hiervoor het hy na die gevaarlikste plek gegaan, waar nie almal glad kan oorleef nie. Daar sal jy hom vind deur na die speletjie Turtle Ninja te gaan. Die nuutgemuntde ninja het reeds sy rustige reis begin, en jou taak is om hom te laat spring sodra 'n verskriklike gekartelde versperring op pad verskyn. Dit sal stadig opstaan, en terselfdertyd sal dieselfde stuk yster van bo af val. Die held moet tussen hulle kom in Turtle Ninja.
