Onder die dekmantel van die duisternis gaan 'n dapper ninja jag en jy moet hom help om sy werk in Night Ninja te hanteer. En dit bestaan uit die skoonmaak van die grondgebied van bandiete wat hulself ook as ninjas beskou en daardeur edele krygers afkraak. Rowers gaan visvang in die nag, so ons held word ook gedwing om in die nag op te tree. In die regter boonste hoek sal jy die taak vir elke vlak sien. Dit lê in die aantal vyande wat vernietig is. Om uit te skakel, moet jy 'n shuriken gebruik, dit van ver af gooi, en 'n katana-swaard vir nabygeveg. Al die nodige knoppies is in die onderste regterhoek in Night Ninja.