Choo Choo Charles Revenge neem jou na die eiland Aranearum, waar 'n verskriklike monster woed: 'n baster van 'n gigapider en 'n trein met die naam Charles. 'n Argivaris, 'n monsterjagter, kon een keer 'n monster verslaan deur dit in 'n tonnel in te ry en dit met 'n spesiale beskermende skild toe te maak. Maar daar was 'n mislukking en Charles het daarin geslaag om los te kom. Hy deursoek die eiland op soek na slagoffers, en jy moet hom vind. Achivarius is met vakansie, jy moet sonder hom veg, en jy, anders as die monsterjagter, sal stap in plaas van trein ry. Soek die eiland, vind die monster en vernietig dit in Choo Choo Charles Revenge.