In die derde deel van die speletjie Sonic Advance 3, sal jy voortgaan om die dapper Sonic en sy vriende te help veg teen die kranksinnige Dr. Evil. Die mal man wil 'n hele stad bou waarin hy monsters sal groei. Om dit te doen, sal hy die klippe van Chaos nodig hê. Sonic moet hulle eers vind. Voor jy op die skerm sal sigbaar wees vir jou karakter en sy metgesel. Deur die beheersleutels te gebruik, sal jy die aksies van albei helde gelyktydig beheer. Jy sal hulle moet laat rondbeweeg op die plek en alles noukeurig inspekteer. Soek vir klippe en voorwerpe wat oral oor die plek gestrooi is en versamel dit. Op jou pad sal jy struikelblokke en strikke teëkom waaroor jou helde sal moet spring. As hulle monsters ontmoet, sal die karakters hulle kan omseil of vernietig deur by die stryd aan te sluit. Vir die doodmaak van teenstanders sal jy punte in Sonic Advance 3 kry.
