Drie ninja-krygers is betrokke by die spel Gone Rogue. Swart Kuro, wat vaardig shurikens gooi, hy het geen gelyke hierin nie. Die rooi vegter Aka is so goed om 'n swaard te swaai dat almal verstom is. Daarbenewens het Aki se swaard magiese vermoëns, dit kan die vyand vertraag as dit hom seermaak. Die groen ninja Midori is 'n taktikus. Hy stel vaardig lokvalle op verskillende plekke sodat die vyand beslis op hulle sal struikel. Al drie krygers het vir 'n rede in Gone Rogue verskyn. Hulle is deur die Keiser gestuur sodat die helde die skurk Uzuri hanteer, wat besig is om een van die grootste dorpies in die ryk te beroof. Jy moet die vyand vernietig voordat hy al die produkte in Gone Rogue versamel.