Niemand betwis die prestasies van die Teenage Mutant Ninja Turtles en die Power Rangers nie, maar hulle kon nie onder mekaar saamstem nie en elke groep beweer dat hulle meerderwaardig is. Om uit te vind wie die beste is, het die helde besluit om gevegte onder mekaar te reël en hulle sal begin sodra jy die spel Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash betree. Jy kies die vegters wat die eerste sal wees om die arena binne te gaan. Na 'n reeks gevegte behoort net een wenner oor te bly. Niemand verplig jou om vir iemand te wortel nie, jy kies 'n held vir jouself en sal dit bevorder, wat help om alle teenstanders in Teenage Mutant Ninja Turtles VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash te verslaan.
