Kyoto, as 'n kind, het in 'n opleiding in 'n tempel ingeskryf waar soldate ninjas oplei. Hy het jare lank in die besit van verskeie koue wapens opgelei en sy vaardighede aangepak. Vandag het hy die finale stadium waarin hy die eksamen voor sy onderwyser sal slaag. Ons is met jou in die spel Fruit Ninja Frenzy help hom hierin. Deur ons swaard in die hand te neem, sal ons held in die geveg staan. Van alle kante sal jy sien hoe verskillende vrugte vlug. Jy beweeg die skerm met jou muis, jy sny dit in dele en verdien dus punte. Maar onthou dat daar onder die vlieënde voorwerpe bomme sal wees. En as jy hulle tref, sal 'n ontploffing voorkom en jy sal die taak misluk.