'n Uitheemse inval in Animals vs Zombies het die verskyning van zombies uitgelok. Ongenooide gaste uit die buitenste ruimte het 'n virus saamgebring wat mense in die lewende dooies verander. Die situasie het vererger totdat 'n vreemde gebeurtenis plaasgevind het. Dit het begin met 'n groep zombies wat beheer word deur aliens wat 'n boer se huis aangeval het. Sy werfhond het tot die eienaar se verdediging gekom en skielik het die zombies teruggetrek. Dit blyk dat troeteldiere 'n bedreiging vir zombies en selfs vreemdelinge is, en hulle het begin om diere te vang en in hokke toe te sluit. In die speletjie Animals vs Zombies sal jy die held help om sy troeteldier te bevry en teen zombies en aliens te veg.
