Die waterwêreld is dikwels gevaarlik en onvoorspelbaar; daar is altyd 'n stryd om oorlewing tussen sy inwoners, en in die spel Fish Runner sal jy van die seediere help om te oorleef en selfs mededingers te verslaan. Jou eerste karakter is 'n oulike dolfyn wat deur die kanaal gelei moet word, kristalle en geld insamel, asook struikelblokke omseil of vernietig. Gee spesiale aandag aan kristalle, dit is dié wat die lewensskaal van jou vis vul. Dit is belangrik, want by die wenstreep wag 'n tweestryd met die vyand en as die lewenskragtigheid nie genoeg is nie, sal jy nie die vyand in Fish Runner kan verslaan nie.