Die woud is 'n plek waarheen mense gaan om sampioene, bessies te pluk, te jag, hout te koop, ensovoorts. Nabygeleë dorpies leef van die woud en as hierdie bron van inkomste verdwyn, ly mense daaronder. Dit is presies wat gebeur het in 99 Nights In The Forest- Battle Squads. Onbekende maar bose monsters het in die woud verskyn en mense kan nie in die woud ingaan nie weens die gevaar om geëet te word. Die jagters het besluit om 'n groep bymekaar te maak om die monsters te veg en te vernietig of hulle uit te dryf. Help om 'n groep te vorm en help hulle om die monsters te verslaan. Soos die geveg vorder, kies verskillende elemente: wapens, beskermende ammunisie, ensovoorts in 99 Nights In The Forest- Battle Squads.
