Jou plaas in Farmers Versus Aliens word ernstig bedreig vanuit die buitenste ruimte. Om een of ander rede het vreemdelinge van 'n verre sterrestelsel besluit om diere van jou plaas af te ontvoer, en dit is glad nie goed nie. Niks kan die verlies van lewende wesens verklaar nie, wie sal glo dat aliens koeie, skape, varke en perde gesteel het. Jy sal hulle moet wegsteek en om dit te doen moet jy die boer help om elke dier in 'n groen driehoekige area te ry waarop die ooreenstemmende dier geteken is. Dit sal al jou lewende wesens wegsteek vir die oë van vreemdelinge. Maar maak gou, anders begin hulle Operasie Farmers Versus Aliens.
