Wetenskaplikes regoor die wêreld, elkeen in hul eie veld, werk onvermoeid om 'n groot ontdekking te maak. Slegs enkeles slaag egter in die meeste studies; Hul befondsing is gesluit weens 'n gebrek aan belofte of mislukkings in eksperimente. Die heldinne van die spel Library Mysteries is studente van een van die bekende universiteite. Amelia, Candice en Ava is passievol oor wetenskap en wil beroemd word. Hulle het verneem dat een van die professore by hul instelling besig was met ernstige wetenskaplike ontwikkeling, maar die projek is gesluit en die professor het verdwyn. Meisies wil graag sy werke in die universiteitsbiblioteek vind en bestudeer. Help die meisies in Library Mysteries.