Die ruimtelandingsmag in Doom 2D is na Mars gestuur, waar 'n kompleks geleë is wat deur die United Space Corporation besit word. Geheime navorsing oor die hel het daar plaasgevind. Die laboratorium is gebou op 'n portaal wat een keer ontdek is en wetenskaplikes het dit begin bestudeer en die moontlikheid om dit tot voordeel van die mensdom te gebruik. Op die ou end het alles glad nie verloop soos beplan nie. Demone het uit die portaal geklim en die koloniste aangeval. Die valskermsoldaat moet geheime navorsinglêers op hardeskywe haal en diegene red wat oorbly. Help hom, hy sal op die perseel moet rondbeweeg en demoniese wesens in Doom 2D beveg.
