Die mafia in Japan word die Yakuza genoem en is 'n baie ernstige kriminele organisasie wat buite die wet funksioneer volgens sy eie reëls. As sy iets nodig het, neem sy dit, ongeag die lewens en behoeftes van diegene wat in hul pad staan. Samurai vs Yakuza stel jou voor aan 'n samurai wat sy dorpie wil red. Die bandiete het van haar gehou vanweë die antieke tempel wat op haar grondgebied geleë is. In hierdie tempel is daar verskeie waardevolle beeldjies wat die hoof van die Yakuza wou besit. Ons held het in die pad van 'n hele mafia-leër gestaan en sal met jou hulp die aanval van rowers met swart gewaad in Samurai vs Yakuza afweer.
