’n Ou met die superkragte van Spider-Man het in buitelandse intelligensie gaan dien en het ’n spesiale agent soos James Bond geword. Maar hy het nie 'n wapen nodig nie; hy hanteer sy vyande. Wat 'n web van die boog los en die vyand daarmee verstrik, wat hom heeltemal immobiliseer. In Mutant Assassin 3D sal jy die held help om missies te voltooi deur ongewenste vyandelike agente uit te skakel. Die vernietigingsmeganisme is eenvoudig: jy rig die groen sirkel op die volgende rooi skurk en laat die web vry. Dit vou om die liggaam en die vyand word verslaan. Op dieselfde manier moet jy hope geld insamel, dit moet ingesamel word om die vlak in Mutant Assassin 3D te voltooi.