Die held van die spel Murder Case Clue 3D is 'n seun genaamd Tom wat lief is vir speurverhale. Hy het al die werke oor Sherlock Holmes en Hercule Poirot gelees en weet presies wat hy sal word wanneer hy groot is. Die ou droom lank daarvan om 'n ware misdaad te ondersoek. Maar wie sal hom toelaat, want hy is nog 'n tiener. Die lewe bring egter soms verrassings. Toe vriende die seun genooi het om 'n naweek saam met hulle in 'n plattelandse huis deur te bring, het hy geen idee gehad hoe dit kon eindig nie. By die gespesifiseerde adres aangekom en die gewenste huis gevind, het die held dit leeg gevind. Al die vriende het vertrek om verklarings aan die polisie te gee omdat 'n moord in die huis plaasgevind het. Terwyl niemand daar was nie, het die seun besluit om die voorval te ondersoek. Niemand sal hom keer om bewyse te soek nie, en jy sal help om vinnig die waarheid in Murder Case Clue 3D vas te stel.
