Die apokalips kan om verskeie redes gebeur, in die spel Apocalypse Run sal jy die held help wat in die middel van die apokalips was wat verskyn het as gevolg van die opstand van die masjiene. Kunsmatige intelligensie, waarvan die voorkoms so gewag is en so bewonder is vir sy vinnige ontwikkeling, het besluit dat dit nou nie mense nodig het nie. Boonop is hulle selfs skadelik, want hulle doen alles verkeerd, tree dikwels irrasioneel op, vernietig die omgewing en maak hul eie soort dood. 'n Sterk oortuiging het in die gedagtes van die masjien gevorm dat die mens die belangrikste euwel op die planeet is en vernietig moet word. So het die sistematiese vernietiging van die mensdom begin, en die held van Apocalypse Run wil dit vermy en jy sal hom help om teen die robotte te veg.
