Jou missie in Save from Aliens III is om die stad te red van 'n uitheemse inval. Slegs jou vegskip sal wagstaan en verdedig. Jy kan nie na vlieg nie, maar beweeg net in 'n horisontale vlak. Onderskep ongeïdentifiseerde voorwerpe wat van bo af vlieg wat soos skepe lyk. Dit is nodig om op hulle te skiet totdat 'n vurige wolk van ontploffing verskyn. Sommige vyandelike vlieënde pieringagtige skepe kan geboue vinniger bereik as ander. Skiet hulle eers en vernietig dan die res. Die aanvalle sal verskerp, jou taak is om te verhoed dat die geboue agter jou vernietig word in Save from Aliens III.
