Uit die verre dieptes van die Melkweg het 'n uitheemse skip op Aarde aangekom. Die skip het oor 'n klein plaas gesweef. Die aliens wil die skape steel en jy in die spel Alien Vs Sheep sal hulle moet keer om dit te doen. Voor jou op die skerm sal die grondgebied van die plaas verskyn waarop die skape sal begin loop. Bo hom sal 'n uitheemse ruimteskip in die lug verskyn, wat na 'n rukkie die skape sal begin aanval om hulle te vang. Jy sal die muis moet gebruik om die aliens van die skape te verdryf. Deur op die skerm te klik met die muis sal jy 'n spesiale ring skep. Deur 'n uitheemse skip daarin te vang, sal jy hulle dwing om na 'n sekere afstand te vlieg. Nadat jy vir 'n voorafbepaalde tyd op hierdie manier uitgehou het, sal jy aanbeweeg na die volgende vlak van die Alien Vs Sheep-speletjie.