Water of enige ander vloeistof, volgens die wette van swaartekrag, sal afvloei as dit 'n uitweg vir homself vind, selfs 'n klein krakie. In Water Flow 3D moet jy dit vrylik laat vloei om die vierkantige houers hieronder vol te maak. Die aantal houers sal verskil, maar jy moet onthou dat jy net vloeistof van die ooreenstemmende kleur daarin kan gooi. Om dit te doen, maak die kleppe in die regte volgorde oop. Soms sal vloeistowwe gemeng moet word, en glasafskortings sal met swaar balle in Water Flow 3D gebreek moet word. Daar is baie vlakke en hulle is uiteenlopend in die opstel van take.