Die diktator se imperiale ambisies het tot ongelooflike afmetings gegroei. Nadat hy die hele planeet heeltemal gevange geneem het, het hy begin om die ruimte in te kyk en het reeds begin om basisse op ander planete te bou, wat geleidelik deur die sterrestelsel versprei het. 'n Handjievol rebelle wat teen die satrap op Aarde geveg het, is gedwing om die ruimte in te trek om die stryd daar voort te sit. In Space Huggers help jy een van die helde om die imperiale verspreiding suksesvol te vernietig. Op elke vlak sal jy sekere missies uitvoer, daar is tien klone om die held te help. Hulle sal onvermydelik sterf, maar met 'n nuwe missie sal die drie hervat. Die ou het nege lewens en 'n gereelde aanvulling van drie na elke suksesvolle voltooiing van die taak. Altesaam vyf missies en aan die einde van die stryd met die baas in Space Huggers.