Spider-Man het soms ongewone dinge gebeur, veral die afgelope tyd. Hy kan in sy huis gaan slaap en op 'n heel ander plek wakker word. Dit is 'n soort magie of supertegnologie, wat u moet uitvind voordat dit erger word. In die spel Marvel Ultimate Spider-man Mystery City vind jy en 'n superheld jouself in 'n geheimsinnige stad wat nie op die kaart is nie. Heel waarskynlik is hy in 'n parallelle heelal. Spider-Man wil verstaan hoe hy in die ruimte vervoer word en hoekom presies hier. Om deur die stad te beweeg. Dit is nodig om presies op die blou teëls te spring en te land, anders kan die held beseer word in Marvel Ultimate Spider-man Mystery City.
