In die spel Kingdom of Ninja gaan jy na die koninkryk waar ninja-krygers woon. Die afgelope jare was daar slegte weerstoestande en die oeste het baie min opgelewer, en bloeddorstige monsters het ook begin verskyn. Die koning het self besluit om die situasie reg te stel, want hy is verantwoordelik vir die lewens van sy inwoners. Om dit te doen, sal hy moet afgaan na die katakombes onder die stad, want dit was van daar dat die wesens van die duisternis in die nag begin opkom het. Daarbenewens het hy in antieke boekrolle gelees dat antieke skatte in hierdie labirinte versteek was, en as hulle almal versamel sou word, sou die bose towery verdryf word. Jy sal jou held vergesel, wat soos 'n swart vierkant met 'n rooi streep op sy oë lyk. Om aan al die voorwaardes uit die antieke kronieke te voldoen, sal hy ongewapen ondergronds moet gaan en slegs ongelooflike behendigheid sal hom help om al die toetse te slaag. Van die eerste tree af sal hy verskeie soorte lokvalle, gate in die grond en hoë rande moet trotseer. Op sommige plekke sal jy mure moet uitklim om by die volgende vloer uit te kom. As jy monsters langs die pad ontmoet, moet jy nie probeer om hulle aan te val nie, want daar is geen kans om die stryd te wen nie. Dit is beter om net oor te spring en voort te gaan soek na skattekiste in Kingdom of Ninja.
