'N Klein groepie gevangenes wat onregmatig veroordeel is, het besluit om 'n tronkstraf te reël. In die spel Prison Break 3D sal u hulle help om vry te kom. Voor u op die skerm sien u u groep in die gang van die gevangenis staan. Hulle kon die slot oopmaak en uit die sel kom. Nou sal u hulle op 'n spesifieke roete moet lei. U kan hul handelinge beheer met behulp van die beheertoetse of die muis. Selle word in die gevangenisperseel geïnstalleer, sowel as wagte. U moet dit oorweeg. U roete moet buite die kameras se toesiggebied wees. U moet ook nie deur die wagte betrap word nie. As dit gebeur, sal daar alarm gemaak word in die gevangenis en word u gevangenes gevang.