In die spel Ninja Monster Killer gaan ons na antieke Japan reis. In die Middeleeue het mense wat magiese magte besit, hier gewoon. Party van hulle het hul krag gebruik om mense te benadeel. Een so 'n towenaar, deur middel van magie en eksperimente, het 'n hele aria van monsters versamel, wat deur 'n spesiale artefak beheer word. Een dapper ninja is opdrag gegee om die voorwerp te steel. Nou moet hy die kasteel betree wat op die berg staan en die voorwerp steel. Die pad van ons held lê op die randjies wat na die top van die berg lei. Hulle sal die monsters wees. Jy beheer die held sal oor hulle moet spring en vorentoe beweeg.
