Boor Banjo, saam met sy suster, woon in die dieptes van die bos. Op een dag het ons karakter wakker geword en gevind dat sy jonger suster ontbreek. Nou in die spel Banjo-Kazooie, sal ons hom help om haar te vind. Vir hulp het ons karakter na die magiese voël Kazue verander. Na 'n magiese ritueel het sy die roete gevang en gevlieg. Nou loop jy die held sal na haar moet hardloop sonder om agter te val. Wees versigtig met die manier waarop jy vullis sal hê en jy ry. Die held sal hulle moet dwing om oor hulle te spring. Soms kan jy verskillende aggressiewe monsters ontmoet en jy sal hulle moet vernietig.
