Onder die Ninjas, sowel as onder gewone mense, kom die slegte ouens en die held van die spel Ninja Fighter saam met hulle en moet veg. Hy is nie alleen nie, daar is vrywillige assistente en hulle sal kom. Maar die grootste hoop vir die held, wat jy sal bestuur. Hy is sterker, meer slinks en almal sal hom volg. Soek vyande en vernietig hulle. Hulle is sterk en het dieselfde geheime as die mees gevorderde ninjas. Maar hulle swakheid is dat hulle kwaad en onbeginsel is, en die goeie oorwin altyd altyd die bose. Bestuur die pyltjies wat onderaan die skerm geteken word as jy op 'n skermtoestel speel. As daar 'n sleutelbord is, gebruik die ASDW sleutels.
