Krusty Krab en SpongeBob Square gebou verdedigende torings te beskerm teen aanvalle plankton. Beide van hulle klim op die dak van die galjoen, sit die geweer en begin verdedigende bedrywighede. Aanvaar en jy deelneem aan hierdie duikboot oorlogvoering met die hoofkarakters van die spel en help hulle om te wen. Skiet die teikens so akkuraat te tref op die dood van 'n leër van mikroskopiese alge. Dop met Krusty sponge bob en die hele water kolom dat geen spioen nie kon sluip in hul kamp en lê 'n bom in die vesting.