Nindroidov groot leër in opstand gekom en begin om die planeet te verower. Dapper helde van die spel "Go Ninja: Staan Nindroidov" probeer om die rebellie te stop, en vir dit wat hulle nodig het om die vyand basis te kry en te vernietig die leier. Voor 'n lang pad, kan jy speel vir elke ninja, wat is in die spel. Verskillende situasies vereis verskillende karakters. Verander die karakters tot lewe kom in die spel in 'n spesiale portaal. As jy wil hê dat die versperring te breek, veroorsaak kragtige ninja met 'n byl, kap dit in stukkies almal. Versamel langs die pad medisyne kabinet nie, maar eerder probeer om vyande uit te hou.