Die held van die spel Final Ninja beskou homself as die laaste ninja van sy soort. Die vyandige stam het daarin geslaag om al die held se familielede uit te roei, maar hy gaan nie moed opgee nie. Al moet hy sterf, is hy van plan om al sy vyande saam te neem. In die tussentyd moet jy die laer van vyande vind en om dit te doen sal jy baie struikelblokke moet oorkom. Gebruik die pyltjies om te beweeg, en deur op die muisknoppie te klik, gooi die shurikens uit. As jy die sleutel inhou terwyl jy gooi, kan jy vasgryp en jouself optrek na hoër platforms waarheen jy nie in Final Ninja kan spring nie.
