Sodra ongewenste persoonlikhede in ons virtuele stad verskyn wat die stad en sy inwoners benadeel, begin die dorpsmense 'n held kies wat die skurke kan weerstaan. Hierdie keer het monsters van die Monstervereniging, wat in weerwil van die Hero Association geskep is, in die stad se strate verskyn. Slegs Saitama of Bald Cloak, oftewel One Punch Man of One Punch Man, kan hulle hanteer. Maar jy moet hom help in One Punch Man 3D Game, want daar sal baie vyande wees en eers moet jy hulle in 'n groot stad vind. Regs bo sal jy 'n navigator met rooi kolletjies daarop vind - dit is die held se doelwitte in One Punch Man 3D Game.