Magical Dragons Difference sal jou na 'n wêreld neem waar magie en towery 'n groot rol speel. Hier is nie gewone mense nie, want net wesens leef. Beskik oor verskillende grade van magiese vermoëns. Onder hulle word 'n spesiale plek beset deur magiese drake. Hulle is baie soortgelyk aan dinosourusse, maar hier word hulle as drake beskou en as heilige diere vereer. Onlangs het 'n towenaar besluit om die populasie van drake te vergroot, maar iets met sy towerspreuke het nie gewerk nie en die drake het dubbelgangers voorgekom. Hulle is nie werklik nie, maar baie soortgelyk. Vind die verskille tussen hulle om te verstaan waar die werklike is en waar is die produk van magie in Magical Dragons Difference.
