Bommenwerpers betree weer die arena en hierdie keer het jy 'n keuse van karakter: Tomato Guy of Pirate King. Sodra jy jou keuse gemaak het, gaan direk na die eerste beskikbare oerwoud-ligging en voltooi al die vlakke. Om dit te doen, moet jy bomme agter jou laat sodat die vyande wat op die vlak is, daarop opgeblaas word. Wanneer jy almal vernietig, sal jy na 'n nuwe vlak beweeg, maar eers nadat die slot-ikoon verskyn het. Versamel trofeebonusse wat die skurke agtergelaat het en gebruik dit om in die Boom Battle Arena te vorder.
