In 'n oorlog probeer die vyand hoofsaaklik om militêre fasiliteite te vernietig: vliegvelde, militêre eenhede, ammunisiedepots. In Atomic Fighter 2D neem jy beheer oor 'n vegvliegtuig om die lug bo 'n militêre basis te beskerm. ’n Eskader vyandelike aanvalsvliegtuie en bomwerpers nader dit reeds. Jou taak is om die verdediging te hou en aktief die vyand langs die hele front aan te val. Beweeg die vegter na links of regs, beweeg weg van die beskutting na die vlieënde vyandelike vliegtuie en val aan en skiet jouself, en vernietig die vliegtuie een vir een. Versamel verskeie bonusse op die vlieg, hulle sal jou help om 'n groot aantal oprukkende vyande in Atomic Fighter 2D te hanteer.
