Baie kinders ly in die kinderjare aan verskillende siektes. Daarom neem hul ouers hulle gereeld na die hospitaal waar hulle behandel word. In Happy Doctor Mania werk u as dokter in een van die hospitale in die stad. Kinders word vandag na u afspraak gebring. Nadat u 'n pasiënt gekies het, sal u by hom op kantoor wees. In die eerste plek moet u die pasiënt ondersoek om sy siekte te diagnoseer. As u dit herken, sal 'n spesiale beheerpaneel verskyn. Met die hulp kan u verskillende soorte mediese instrumente en dwelms gebruik. Deur sekere aksies konsekwent uit te voer, sal u die pasiënt genees en na die volgende pasiënt gaan.