Terwyl hy deur die ruimte gereis het, ontdek die ruimtevaarder Jack 'n groot drywende basis. Ons held het besluit om haar deur te dring en te verken. Maar eers moet hy 'n landingstuig vind. U in die spel Endless Space Pilot sal hom hiermee help. U sal op 'n spesifieke roete op u ruimteskip vlieg. Op pad sal u hindernisse en verskillende lokvalle teëkom. As u slim op u skip beweeg, moet u oral om hulle heen vlieg. Onthou dat botsings met 'n hindernis die skip skade berokken en dat jou held sal sterf.