Dapper Ninja Kyoto het take van die hoof van sy bestelling ontvang en jy in die spel Super Ninja Hero sal hom moet help om dit te voltooi. Jou held moet in die kasteel van een aristokraat deur die kerker ingaan en daar belangrike dokumente steel. Al die kerker sal 'n deurlopende hindernisbaan wees. As jy jou held goed beheer, sal hulle almal moet oorkom. Ook, jou held sal moet veg met verskeie monsters en soldate van beskerming, wat in hierdie doolhof is. Onderweg moet jy verskeie items en wapens oral versprei, versamel.