In die pixel wêreld het die einde van die wêreld begin. Dit is nie bekend waar die hordes van die lewende dooies vandaan gekom het nie, wat nou klein stede aanval en mense doodmaak en hulle na soortgelyke mense verander. Maar daar was dapper mense in die wêreld wat wapens opgeneem het om hul nedersettings te verdedig. Jy in die spel Pixel Shot sal een van hulle wees. Jou karakter sal deur die strate van die dorp moet hardloop en al die zombies moet kry. Met die hulp van sy kragtige wapens kan hy al die monsters vernietig. Onderweg moet hy verskeie items versamel wat hom sal help in die stryd teen die lewende dooies.