Nadat hulle op een van die planete geland het, het aardbewoners 'n navorsingsbasis daar georganiseer en begin 'n stad vir immigrante bou wat binnekort hier sou aankom. Soos dit blyk, het die uitheemse ren op die naburige vasteland geleef. Hulle het 'n weermag gevind om dit te vernietig. Jy in die spel Base Defense sal die verdediging basis moet opdrag gee. Met die hulp van 'n spesiale beheerpaneel bel jy die soldate en stuur hulle in die geveg. Verdeel jou kragte vaardig. Elkeen van jou krygers besit hul wapens en het hul eie eienskappe.