Lede van die Liga van Justisie staan wakker oor die wet en orde in ons wêreld. Hulle help al die inwoners van die aarde wat sukkel met misdaad en verskeie vreemdelinge van monsters. As een mal wetenskaplike het 'n fabriek gebou vir die vervaardiging van strydrobotte en met die hulp van hulle wou ons wêreld vang. Ons sal in die spel Justice League: Nuclear Rescue, saam met lede van die Justice League, die plant binnekom en dit vernietig. Hulle moet deur sy winkels hardloop en dieper in die dieptes binnedring. Onderweg moet jy verskeie deure oopmaak met hefbome en 'n paar vermoëns van ons helde. Al die vyande wat jy ontmoet, kan jy vernietig.