Op die New York ineengestort werklike bedreiging in die vorm van 'n kragtige shredder. Hy sal probeer om die stad te neem in minute, maar jy moet hom saam stop met mutant Ninja Turtles. Hierdie dapper ouens is gereed vir enige probleme na sy tuisdorp te red van die waansin. Elkeen van die karakters sal hul eie missie en doel het, iemand het om 'n doepa voor te berei om die gemuteerde iemand vernietig te skiet missiel laaiers, en iemand om die vyand te verslaan in noue bestry. Alle skilpaaie sal slegs drie pogings, as jy verloor, sal die stad val.